Gene Detail

Wpig01-g1223.t1

Species: Whitmania pigra

NCBI Taxonomy ID: 486152

Preferred name: DENND4B

Description: Rab guanyl-nucleotide exchange factor activity

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Genome Location

Contig: Wpig01
Feature: exon
Coordinates: 186222 - 186358 (-)
Source file: Whitmania_pigra.chr.ANNEVO.gff3.gz

The bar shows the gene locus on the contig. It is an approximate visualization based on available GFF data.

Sequences

Protein Sequence

Whitmania_pigra.chr.ANNEVO.pep.fasta.gz (protein)

Functional Annotation

Preferred name	DENND4B
Description	Rab guanyl-nucleotide exchange factor activity
Seed ortholog	6412.HelroP68059
Score	1025.0
EggNOG OGs	KOG2127@1\|root,KOG2127@2759\|Eukaryota,38F94@33154\|Opisthokonta,3BA52@33208\|Metazoa,3CTGF@33213\|Bilateria
Max annotation level	2759\|Eukaryota
COG category	T
GOs	GO:0002790, GO:0003674, GO:0003676, GO:0003677, GO:0005085, GO:0005088, GO:0005488, GO:0005515, GO:0005516, GO:0005575, GO:0005622, GO:0005623 GO:0002790, GO:0003674, GO:0003676, GO:0003677, GO:0005085, GO:0005088, GO:0005488, GO:0005515, GO:0005516, GO:0005575, GO:0005622, GO:0005623, GO:0005634, GO:0005737, GO:0005768, GO:0005794, GO:0005829, GO:0005886, GO:0005938, GO:0006355, GO:0006810, GO:0008104, GO:0008150, GO:0009306, GO:0009719, GO:0009725, GO:0009889, GO:0009966, GO:0009987, GO:0010033, GO:0010243, GO:0010468, GO:0010556, GO:0010646, GO:0012505, GO:0012506, GO:0015031, GO:0015833, GO:0016020, GO:0016043, GO:0017016, GO:0017112, GO:0017137, GO:0019219, GO:0019222, GO:0019899, GO:0022607, GO:0023051, GO:0030141, GO:0030198, GO:0030659, GO:0030904, GO:0031090, GO:0031267, GO:0031323, GO:0031326, GO:0031410, GO:0031982, GO:0032483, GO:0032593, GO:0032868, GO:0032869, GO:0032870, GO:0032879, GO:0032880, GO:0032940, GO:0032991, GO:0033036, GO:0034613, GO:0042221, GO:0042886, GO:0042996, GO:0042998, GO:0043062, GO:0043085, GO:0043087, GO:0043226, GO:0043227, GO:0043229, GO:0043231, GO:0043434, GO:0043547, GO:0044085, GO:0044093, GO:0044422, GO:0044424, GO:0044425, GO:0044433, GO:0044444, GO:0044446, GO:0044448, GO:0044464, GO:0045175, GO:0045177, GO:0045179, GO:0045184, GO:0046578, GO:0046903, GO:0048518, GO:0048522, GO:0048583, GO:0050789, GO:0050790, GO:0050794, GO:0050896, GO:0051020, GO:0051049, GO:0051050, GO:0051056, GO:0051128, GO:0051171, GO:0051179, GO:0051222, GO:0051223, GO:0051234, GO:0051252, GO:0051336, GO:0051345, GO:0051641, GO:0051716, GO:0055037, GO:0060255, GO:0060341, GO:0060627, GO:0061864, GO:0061865, GO:0065007, GO:0065009, GO:0070201, GO:0070278, GO:0070727, GO:0070831, GO:0070887, GO:0071310, GO:0071375, GO:0071417, GO:0071495, GO:0071702, GO:0071705, GO:0071711, GO:0071840, GO:0071944, GO:0072657, GO:0072659, GO:0080090, GO:0090087, GO:0090630, GO:0097159, GO:0097574, GO:0097575, GO:0097708, GO:0098772, GO:0098796, GO:0099503, GO:0099568, GO:0099738, GO:0110010, GO:0110011, GO:1901363, GO:1901652, GO:1901653, GO:1901698, GO:1901699, GO:1901700, GO:1901701, GO:1902531, GO:1903053, GO:1903076, GO:1903078, GO:1903506, GO:1903827, GO:1903829, GO:1904375, GO:1904377, GO:1904951, GO:1905475, GO:1905477, GO:1990778, GO:2000112, GO:2001141
EC number	-
KEGG KO	K20163
KEGG pathway	-
KEGG module	-
KEGG reaction	-
KEGG RClass	-
BRITE	ko00000, ko04131
KEGG TC	-
CAZy	-
BiGG reaction	-
PFAMs	DENN,PPR_3,dDENN,uDENN

InterProScan Annotation