Gene Detail

View functional annotation, sequence and genome location for gene Wpig01-g1231.t1.

Wpig01-g1231.t1

Species: Whitmania pigra

NCBI Taxonomy ID: 486152

Preferred name: LHX1

Description: binding. It is involved in the biological process described with regulation of transcription, DNA-templated

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Genome Location
  • Contig: Wpig01
  • Feature: exon
  • Coordinates: 326735 - 326765 (-)
  • Source file: Whitmania_pigra.chr.ANNEVO.gff3.gz

The bar shows the gene locus on the contig. It is an approximate visualization based on available GFF data.

Sequences
Protein Sequence
Whitmania_pigra.chr.ANNEVO.pep.fasta.gz (protein)
MMIVRCAGCDAPIQDRFLMTVLDKKWHTCCVVCCVCGIPLSEKCFSREGRLFCREDFLRIFGTKCAGCDQVILSHDLVRRARDRIYHVACFVCAVCKRQLTTGEQLYVVSDCHLLCGRDYFQLAEEEQALEGEGGDFADDQSGKGLLDESLPSKMASDGGHVEMWAKMEDSQFDGKHCDLQISKTIKNEEIADDDYEEALSVSGDESPPSSPGNSIDPRHLNDVCSRAAHGDLSKVKDLERGLVGEMMMGSVEGQVEGQTNNVGKRRGPRTTIKAKQLETLKNAFANTPKPTRHIREQLAQETGLNMRVIQVWFQNRRSKERRMKQFNAQGLRRNFFRNPRRIQRVPLVGENHLDHPHLLMRDFFMKGGEVAGEFMTRSHPCPGVQGCYPTHADSSELYDTHRMYGGAEVLYPDFYSSIGLNHVAQSANQMQGMVHPLTNQRAATQTSSSQPIATIHYPMANSDLQNQPAMPSQKFQPVIRGHVPMNDQSNLDSDFSDLDAVDQSEQGMNRQNFIVPQRFVSYSKEMSNRSAPPPTAVDSNSLSPSMASLPILSSSSSSSLVPSSSSSSSFFCFVRTCL
Functional Annotation
Preferred name LHX1
Description binding. It is involved in the biological process described with regulation of transcription, DNA-templated
Seed ortholog 126957.SMAR007885-PA
E-value 4.4e-83
Score 276.0
EggNOG OGs KOG0490@1|root,KOG0490@2759|Eukaryota,39EEG@33154|Opisthokonta,3B9QY@33208|Metazoa,3CRVM@33213|Bilateria,41WZ0@6656|Arthropoda
Max annotation level 2759|Eukaryota
COG category K
GOs
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EC number -
KEGG KO K09372, K09376, K18493
KEGG pathway MAP04550
KEGG module -
KEGG reaction -
KEGG RClass -
BRITE ko00000, ko00001, ko03000
KEGG TC -
CAZy -
BiGG reaction -
PFAMs Homeobox,LIM
InterProScan Annotation
No InterProScan annotation rows were found for this gene.
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