Gene Detail

View functional annotation, sequence and genome location for gene Wpig01-g22.t1.

Wpig01-g22.t1

Species: Whitmania pigra

NCBI Taxonomy ID: 486152

Preferred name: FRS3

Description: optic placode formation involved in camera-type eye formation

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Genome Location
  • Contig: Wpig01
  • Feature: exon
  • Coordinates: 347400 - 348063 (+)
  • Source file: Whitmania_pigra.chr.ANNEVO.gff3.gz

The bar shows the gene locus on the contig. It is an approximate visualization based on available GFF data.

Sequences
Protein Sequence
Whitmania_pigra.chr.ANNEVO.pep.fasta.gz (protein)
MGCLMTKRPHPTSSSAAFLLELNPYLFKVANVDDTGEEQNHGLLEVKDQELLFHQASTLTVLRNGSCRSNGVANGASRVETGHDPATSGVENPPPIRWPLKSLRRYGFDADLFSFESGRRCATGPGIYAFRCDRAETLFNLVQDSIIRLGQAEEEEAGRRRLLQTTNQNSASGFAGFRGRFAGPATPPVVTSHDLSSLFGRRNDLQQQRIRFDRSISTPCRDGDVDYTNDGRSRQTHEYLNQQINDNDVDDRHSNLYVNRDVDPSSPSANRQTVQYAQLVVPPRAGSGSPSAGDGAEDDDYDEERDCFDPDLPPYQSCKYINLSKVDASVFEGRRIASVPLRLCRGDVSPSLATVAASNSRMTPVARVTPLGNYVNFDGEERTPVEGREGLVNYIQLDLDGSCFANNGESSKIAGRPNGDSNAEPLRRGVLKSDSGIQRSPRTAGGSAGESYATIDLRRTRAISCRAVLAETYDEGSRKTRHNSNIES
Functional Annotation
Preferred name FRS3
Description optic placode formation involved in camera-type eye formation
Seed ortholog 6412.HelroP137354
E-value 5.5e-35
Score 133.0
EggNOG OGs KOG4047@1|root,KOG4047@2759|Eukaryota,38BKI@33154|Opisthokonta,3BEYY@33208|Metazoa,3CZQN@33213|Bilateria
Max annotation level 2759|Eukaryota
COG category T
GOs
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EC number 5.2.1.8
KEGG KO K12461, K12733
KEGG pathway MAP03040, MAP04714, MAP04722, MAP05205
KEGG module M00355
KEGG reaction -
KEGG RClass -
BRITE ko00000, ko00001, ko00002, ko01000, ko03041, ko03110
KEGG TC -
CAZy -
BiGG reaction -
PFAMs IRS
InterProScan Annotation
No InterProScan annotation rows were found for this gene.
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