Paraescarpia echinospica

NCBI Taxonomy ID: 2080241

Taxonomy

  • PhylumAnnelida
  • ClassPolychaeta
  • OrderSabellida
  • FamilySiboglinidae
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Assembly Statistics

  • Size1102.0 Mb
  • Repeat58.31 %
  • Assembly Levelchromosome (14)
  • GC Content40.64 %
  • Scaffold N5069 Mbp
  • Gene Count22,642
  • Gene Count (ANNEVO)26,262
GenomeS:93.8%,D:2.8%
GeneS:72.2%,D:2.1%
Gene (ANNEVO)S:88.5%,D:3.0%

BUSCO Completeness

BUSCO plot

Publication References

  • Genomic Signatures Supporting the Symbiosis and Formation of Chitinous Tube in the Deep-Sea Tubeworm Paraescarpia echinospica.
    Molecular biology and evolution · 2021-09-01
    10.1093/molbev/msab203
    Authors: Sun Y, Sun J, Yang Y, Lan Y, Ip JC, Wong WC, Kwan YH, Zhang Y, Han Z, Qiu JW, Qian PY

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Genome FASTA
Gene GFF3
Gene GFF3 (ANNEVO)
Gene GTF
Protein FASTA
Protein FASTA (ANNEVO)
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Gene Bed
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InterProScan Annotation

Annotation

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query seed_ortholog evalue score eggNOG_OGs max_annot_lvl COG_category Description Preferred_name GOs EC KEGG_ko KEGG_Pathway KEGG_Module KEGG_Reaction KEGG_rclass BRITE KEGG_TC CAZy BiGG_Reaction PFAMs
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